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一、税费负担重
据调查，目前小微企业各项税费负担较重，部分小微企业各项税费占利润的比重甚至高达60%左右。小微企业需要缴纳20多种税费，且大部分与大企业适用的税率相同。一些小企业反映，如果把各种隐性、显性的税负加在一起，企业的平均税负在40%以上。即使是将小型微利企业的税收优惠政策因素考虑在内，与国际平均水平相比，我国小型微利企业的税费也要高出2个百分点。
二、成本压力大
企业发展中受制因素诸多，原材料价格上涨、用工成本增加、人才匮乏等问题都严重困扰着小微企业实现新发展。2011年众多小微企业感受到的最大压力就是原材料和员工工资的快速上涨。在目前我国人口逐步老龄化的新形势下，工资水平自然水涨船高。2011年小微企业雇佣工人的工资水平较2010年出现了20%到30%的卜涨，除了工资上涨外，原材料价格上涨更是让小微企业感到负担加重。根据调查结果，“长三角”的小微企业认为2011年原材料成本上涨对企业经营影响较大的企业高达81%，而201O年只有56%。三、融资困难
小微企业融资难的现象非常普遍。目前的银行结构是大银行多，能够为小微企业服务的小银行数量不足，加之小微企业交易成本高、信息不对称、经营风险较大，使其在信贷筛选中处于不利地位。同时，较高的纳税标准，一方面，不利于小企业增加利润留存，增强承债偿债的融资能力，不利于维持简单再生产和扩大再生产;另一方面，一些小企业出于避税目的，不愿意披露过多的经营信息，使得银企信息不对称，影响其信用评级，加大了其融资难度。
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