HR法律网律师为您解答:您好，严格来说，补充医疗保险是单位享受5%税惠（企业所得税）；但对于员工来说，是应该合并入当期工资收入征税的（个人所得税）。当然，实操中有些地方税局在这一条上查得不严，所以有些单位没有扣个税也没有被查出来。但是，从政策文件上来讲，企业为职工交纳补充医疗保险，应按规定扣缴个人所得税。 《国家税务总局关于单位为员工支付有关保险缴纳个人所得税问题的批复》（国税函[2005]318号）规定：“依据《中华人民共和国个人所得税法》及有关规定，对企业为员工支付各项免税之外的保险金，应在企业向保险公司缴付时（即该保险落到被保险人的保险账户）并入员工当期的工资收入，按‘工资、薪金所得’项目计征个人所得税，税款由企业负责代扣代缴。”目前国家只对法定福利免征个人所得税外，只有很少的商业保险费用可以免征，如：1、企业依照国家有关规定为特殊工种职工支付的人身安全保险费2、为从事高危工种职工投保的工伤保险3、为因公出差的职工按次投保的航空意外险，除此之外，并未规定其他商业性补充保险可以免征。因此，企业为职工交纳补充医疗保险，应按规定扣缴个人所得税。而且，在后来的税务总局下发的文件中，还予以了特别明确强调。例如：《国家税务总局大企业税收管理司关于2009年度税收自查有关政策问题的函》（企便函[2009]33号）规定：“（三）企业为职工购买的人身意外险的个人所得税问题。 根据《国家税务总局关于单位为员工支付有关保险缴纳个人所得税问题的批复》（国税函[2005]318号）规定，企业为员工支付各项免税之外的保险金，应在企业向保险公司缴付时并入员工当期的工资收入，按“工资、薪金所得”项目计征个人所得税。（四）企业年金的个人所得税问题。 根据《财政部国家税务总局关于个人所得税有关问题的批复》（财税[2005]94号）规定，应按企业统一计提年金时所用的具体标准乘以每人每月工资总额计算个人每月应得年金，扣缴个人所得税。（六）企业为职工缴付的补充医疗保险的个人所得税问题。 根据《财政部国家税务总局关于住房公积金医疗保险金、养老保险金征收个人所得税问题的通知》（财税字[1997]144号）规定，应扣缴个人所得税。如果企业委托保险公司单独建账，集中管理，未建立个人账户，应按企业统一计提时所用的具体标准乘以每人每月工资总额计算个人每月应得补充医疗保险，全额并入当月工资扣缴个人所得税。”
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