公诉案件不能申请强制执行。公诉案件应当由人民法院作出判决，在判决书发生法律效力后，人民法院会按照不用的刑罚来采取不用的执行方式，判处死刑的，应当经过死刑复核程序来确定是否执行死刑；判处人身罚的，应当根据人身罚的情况来确定是由监狱、公安机关，还是社区矫正来执行；判处财产刑的，应当由人民法院执行。因此公诉案件被判处刑罚后，不需要申请强制执行，司法机关应当根据刑罚的情况来确定执行方式。
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