法院的抚养权归属判决是在有利于保护子女利益的前提下做出的，孩子的个数不是决定抚养权归属的要素，但是会影响法院的判断。如果孩子和一方生活，明显不利于孩子的成长的，法院会将孩子一起判决给有利于孩子成长的一方。如果父母的经济情况、身体心理情况差不多，法院认为孩子无论随谁生活都可以的，可能会判决父母一人抚养一个孩子。
法律依据：《民法典》第一千零八十四条，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。 离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。 已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
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离婚后不满两周岁的孩子应当由母亲一方抚养。 如果母亲有以下情形之一的，也可随父方生活： (1)患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的； (2)有抚养条件