人民法院之间因管辖权发生争议的，按以下情况处理： 1、两个法院都认为自己有管辖权，一般适用谁先立案谁管辖；如果发生巧合，两个法院同时立案了，那么报请共同的上级法院指定管辖； 2、两个法院都认为自己没有管辖权，则协商解决，协商不成的，同样报由两个共同上级人民法院指定管辖； 3、如果双方不同属一地、市的基层人民法院，但是同属一省、同属一省、自治区、直辖市，各自报自己的上级法院，逐级报到省、自治区； 直辖市的高级人民法院，由其指定管辖；如双方为跨省、自治区、直辖市的人民法院，先由双方的高级人民法院协商，协商不成的，由最高人民法院指定。
法律依据：《民事诉讼法》第三十七条，有管辖权的人民法院由于特殊原因，不能行使管辖权的，由上级人民法院指定管辖。 人民法院之间因管辖权发生争议，由争议双方协商解决；协商解决不了的，报请它们的共同上级人民法院指定管辖。
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