变造公司债券罪既遂的惩罚有：数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处一万元以上十万元以下罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处二万元以上二十万元以下罚金。单位犯前两款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照自然人犯罪的规定处罚。
法律依据：《中华人民共和国刑法》第一百七十八条 伪造、变造股票或者公司、企业债券，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处一万元以上十万元以下罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处二万元以上二十万元以下罚金。单位犯前两款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前两款的规定处罚。
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我国《刑法》中关于变造企业债券罪的量刑的规定是：如果涉罪数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处二至二十万元罚金；数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处
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