公诉转自诉案件其实是对公安机关、检察院行为的一种审查，是一种监督纠错机制。它本质上仍是公诉案件，只不过赋予了被害人自诉的救济权利，因此是不允许调解的，除了民事赔偿部分。
法律依据：《刑事诉讼法》第一百八十条规定，对于有被害人的案件，决定不起诉的，人民检察院应当将不起诉决定书送达被害人。被害人如果不服，可以自收到决定书后七日以内向上一级人民检察院申诉，请求提起公诉。人民检察院应当将复查决定告知被害人。对人民检察院维持不起诉决定的，被害人可以向人民法院起诉。被害人也可以不经申诉，直接向人民法院起诉。
法律知识延伸阅读
(1)生效的时间不同。调解书自送达之日起具有法律效力。仲裁裁决书并不是送达后立即生效，而是当事人自收到裁决书之日起15日内不起诉的，裁决书即发生法律效力。 (2)提起诉讼的
可以的。轻伤或重伤的故意伤害的刑事案件，在民事方面当事人都可以和解，和解后打人的人可以取保候审出来，案件移送到检察院可以作相对不起诉，案件移到法院也可以判处缓刑。 法律
法院的调解书具有法律强制力，法院依制作的调解书符合法律规定的，调解书生效后是具有法律效力的，如果一方不执行的，另一方可以申请强制执行。 法院调解书与判决书具有同等法律效