工程质保金比例不低于多少的规定是工程质保金预留比例不高于结算总额的3%，也是出自《清理保证金通知》中的要求。 根据法律法规并未强制性要求工程质保金的预留比例，只是规定使用政府投资的建设项目按工程价款结算总额5%左右的比例预留保证金，社会投资项目可参照执行。实践中虽然大部分工程项目的质保金的预留比例未超过5%，工程质保金3%最新规定但对于一些新型或风险较大的项目，发包人还是会预留较大比例的工程质保金，作为其项目的风险控制措施。
法律依据：《清理保证金通知》。
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