医疗事故赔偿调解方式有： 1.医患双方自行调解，双方对医疗事故的赔偿责任达成一致协商意见的，可签定书面的调解协议书； 2.请求卫生行政部门主持调解，已确认为医疗事故的，双方当事人可请求卫生行政部门就医疗赔偿问题进行调解。
法律依据：根据《医疗事故处理条例》第三条，处理医疗事故，应当遵循公开、公平、公正、及时、便民的原则，坚持实事求是的科学态度，做到事实清楚、定性准确、责任明确、处理恰当。
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