建设工程施工合同被确认无效后，已履行的合同内容无法直接返还，应折价补偿。建设工程经竣工验收合格，实际施工人可参照合同约定主张工程款;发包人实际参与了管理，也可参照合同约定主张管理费的情况而定。
法律依据：最高人民法院《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律若干问题的解释》第二十一条规定，当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的依据，其适用前提应为备案的中标合同合法有效，无效的备案合同并非当然具有比其他无效合同更优先参照适用的效力。
法律知识延伸阅读
工程价款的结算方式主要有以下几种： 1.按月定期结算。按月定期结算是指每月由施工企业提出已完成工程月报表，连同工程价款结算账单，经建设单位签证，交建设银行办理工程价款结算
(1)贯彻执行国家和工程所在地政府的有关法律、法规和政策，执行企业的各项管理制度； (2)严格财务制度，加强财经管理，正确处理国家、企业与个人的利益关系； (3)执行项目承包合同中
停工留薪期工资的标准，根据《工伤保险条例》第三十三条规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按