如果协议有明确条款说明盖章后生效，但只有法人代表签字，没盖公章，协议还不能生效。没有这个盖章后生效的条款，双方有法人代表签字，没盖公章，协议就已经生效。
法律依据：《中华人民共和国民法典》第四百九十条当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。 法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
法律知识延伸阅读
运输人没有按合同的约定，将货物运输到合同指定的地点，而是将合同约定的货物卖掉，主观上有非法占有目的，是属于合同诈骗的行为，货物案值达到较大的，构成合同诈骗罪。 法律依据： 《
买卖合同起草要件： 1、订约主体存在双方或多方订约当事人，且当事人具有行为能力。 2、订约当事人对合同的主要条款达成合意。 3、双方当事人订立合同必须是依法进行的。 4、
兼并合同注意事项有： 1、资本、资产方面的风险 (一)注册资本问题 (二)公司资产、负债以及所有者权益等问题 2、财务会计制度方面的风险 3、税务方面的风险 4、可能的诉讼风