医疗事故调解的进行流程是： 1、双方当事人共同申请卫生行政部门进行调解； 2、调解应当遵循当事人双方自愿原则，并根据法律规定计算赔偿数额； 3、双方当事人就赔偿数额达成协议的，制作调解书。
法律依据：《医疗事故处理条例》第四十八条，已确定为医疗事故的，卫生行政部门应医疗事故争议双方当事人请求，可以进行医疗事故赔偿调解。调解时，应当遵循当事人双方自愿原则，并应当依据本条例的规定计算赔偿数额。 经调解，双方当事人就赔偿数额达成协议的，制作调解书，双方当事人应当履行；调解不成或者经调解达成协议后一方反悔的，卫生行政部门不再调解。
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如果发生医疗事故纠纷后，患者及其家属不愿意与医疗机构协商、或者医疗机构不同意做医疗事故鉴定的，患者及其家属单方面申请卫生行政部门处理的，应当提出书面申请。申请书应当
陈述书按照下列顺序撰写： 1、患者在被诉医院的医疗过程、发生的不利后果 2、病历资料是否存在不真实的内容，如果存在应当指出具体内容并附具相关证据，同时表明态度是希望鉴定
(一)不涉及财产关系的：2000元-30000元/件。 上下浮动幅度：20% 但收费额不足2000元的按2000元收取。 (二)涉及财产关系的，按争议标的额的以下费率实行分段累计收费： 标的额费率