公诉案件不能调解。我国法律将公诉案件的起诉权赋予人民检察院。公诉案件是由检察机关提起的，涉及到国家公权力的行使问题，公诉案件的起诉权是重要的司法权，属于公权力，私人无权行使，即不能私了。如果公诉案件中的双方当事人已自行私了，检察机关仍然可以提起公诉，人民法院仍然可以进行审判。
法律依据：《刑事诉讼法》第一百八十六条规定，人民法院对提起公诉的案件进行审查后，对于起诉书中有明确的指控犯罪事实的，应当决定开庭审判。
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