在我国允许土地使用权与房屋所有权分离的情形存在，因此，你想要的协议是可以写的。这里可以给你一个协议的框架：土地房屋协议书（协议的名字）。第一条，写清楚房屋的座落位置、四邻以及用地面积、建筑面积、层数，必要时可以附图。第二条，写明房屋建成时间、投资情况。第三条，写明房屋所有权归妹妹和妹夫，土地使用权归你，并写明相关证件办理的责任及费用承担。第四条，写明如果将来房屋拆迁，那么房屋的补偿安置属于妹妹、妹夫，宅基的征收补偿安置属于你。其余的就是写明本协议一式两份，双方各执一份，协议于双方签字（按印）时生效，并签名、按手印，等。需要另外说明一点，因妹妹在本村结婚，户口不迁走，因此，妹妹结婚后符合分户的条件，这样，妹妹是可以单独申请宅基地的。
法律知识延伸阅读
1、甲方义务 a、负责与船东签订劳务外派协议，负责向乙方解释本外派合同，说明工作性质和内容。维护乙方在外派期间的合法权益。 b负责办理派遣乙方赴外轮工作的有关出国手续。
具有法律效力，受法律保护。只要是没有损害他人利益以及违法事项，签字按手印后生效。 夫妻可以约定婚姻关系存续期间所得的财产以及婚前财产归各自所有、共同所有或部分各自所
根据《中华人民共和国农村土地承包法》第四十一条之规定：“承包方有稳定的非农职业或者有稳定的收入来源的，经发包方同意，可以将全部或部分土地承包经营权转让给其他从事农业