派出所调解不会留有案底。民事纠纷只是在派出所留有问询记录或调解记录，不叫案底。留有案底的是属于刑事案件。
法律依据：《中华人民共和国人民调解法》第三条，人民调解委员会调解民间纠纷，应当遵循下列原则： （一）在当事人自愿、平等的基础上进行调解； （二）不违背法律、法规和国家政策； （三）尊重当事人的权利，不得因调解而阻止当事人依法通过仲裁、行政、司法等途径维护自己的权利。
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对于派出所不立案的，可以向上一级公安机关申请复议。同时也可以向检察院申诉部门提出，请求检察院予以监督。被害人认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查，向人民检察
医疗事故调解的进行流程是： 1、双方当事人共同申请卫生行政部门进行调解； 2、调解应当遵循当事人双方自愿原则，并根据法律规定计算赔偿数额； 3、双方当事人就赔偿数额达成协议
(一)不涉及财产关系的：2000元-30000元/件。 上下浮动幅度：20% 但收费额不足2000元的按2000元收取。 (二)涉及财产关系的，按争议标的额的以下费率实行分段累计收费： 标的额费率