申请取保候审保证金的方式为犯罪嫌疑人、被告人在取保候审期间未违反相关法律规定的，取保候审结束时，凭解除取保候审的通知或者有关法律文书到银行领取退还的保证金。
法律依据：《刑事诉讼法》第六十八条 人民法院、人民检察院和公安机关决定对犯罪嫌疑人、被告人取保候审，应当责令犯罪嫌疑人、被告人提出保证人或者交纳保证金。 第七十三条 犯罪嫌疑人、被告人在取保候审期间未违反本法第七十一条规定的，取保候审结束的时候，凭解除取保候审的通知或者有关法律文书到银行领取退还的保证金。
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